Seiring dengan berjalannya waktu, santri yang ikut mengaji semakin banyak dan bahkan ada santri yang datang dari berbagai daerah mulai dari Gringsing, Limpung, dan Pekalongan. Dengan semakin tambahnya santri, rumahnya yang kecil tidak cukup menampung para santri.
Pada usia sekitar 30 tahun, Wali Joko dengan dibantu para santrinya, membangun masjid kisaran pada tahun 1493 M sehingga cukup untuk menampung santri yang mengaji di sana. Masjid tersebut adalah masjid Agung Kendal yang kini berada di pusat kota. Bangunan masjid yang pertama dibangun berukuran 27 x 27m2 dengan 16 saka dan atapnya bersusun tiga dibuat dari sirap dan tempat wudhu yang berbentuk kolam pendem yang mendapat aliran air dari sungai Kendal yang dibuat sendiri oleh Wali Joko dengan menggoreskan tongkat dari kedung pengilon, Desa Magangan.
Untuk memenuhi kebutuhan para santri dan pemeliharaan masjid, Wali Joko dibantu para santri dan kaum muslimin di daerah tempat tinggalnya, ia membuka lahan pertanian di Desa Kauman, Karangsari, Langenharjo, dan Sukolilang yang memiliki luas sekitar 49 Ha. Tanah tersebut diolah oleh para santri dan masyarakat untuk memenuhi kebutuhan pangan mereka dan sebagian lagi digunakan untuk pemeliharaan masjid. Kini tanah tersebut menjadi bondo Masjid Agung Kendal dengan status wakaf bersertifikat.
Seluruh kehidupan Wali Joko, ia persembahkan untuk menyebarkan ajaran agama Islam. Bahkan, ia rela untuk tidak melepas masa lajangnya dan tidak menikah hingga meninggal pada usia sekitar 63 tahun pada tahun 1526 M demi tersebar luasnya agama Islam. Karena itu, ia dikenal dengan Wali Joko (perjaka). Setelah meninggal, ia dimakamkan di rumahnya yang terletak di sebelah tenggara Masjid Agung Kendal.
Cerita di atas bersumber dari KH. Ma’mun Amin, Ketua Tamir Majid Agung Kendal.
 dari hasil pernikahannya dengan Sri Muradaningrum (Candrawati).){kind=link}